Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spi1P17433 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spi1P17433 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spi1P17433 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spi1P17433 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spi1P17433 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spi1P17433 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spi1P17433 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spi1P17433 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spi1P17433 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spi1P17433 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spi1P17433 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spi1P17433 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spi1P17433 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spi1P17433 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spi1P17433 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spi1P17433 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spi1P17433 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spi1P17433 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spi1P17433 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spi1P17433 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Spi1P17433 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spi1P17433 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spi1P17433 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spi1P17433 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spi1P17433 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spi1P17433 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spi1P17433 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spi1P17433 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spi1P17433 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spi1P17433 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Spi1P17433 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spi1P17433 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spi1P17433 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Spi1P17433 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spi1P17433 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spi1P17433 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spi1P17433 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spi1P17433 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spi1P17433 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spi1P17433 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spi1P17433 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spi1P17433 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spi1P17433 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spi1P17433 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spi1P17433 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spi1P17433 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Spi1P17433 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spi1P17433 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spi1P17433 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spi1P17433 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spi1P17433 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spi1P17433 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spi1P17433 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spi1P17433 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spi1P17433 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spi1P17433 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spi1P17433 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spi1P17433 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spi1P17433 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spi1P17433 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spi1P17433 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spi1P17433 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spi1P17433 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spi1P17433 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spi1P17433 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spi1P17433 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spi1P17433 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spi1P17433 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spi1P17433 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spi1P17433 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spi1P17433 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spi1P17433 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spi1P17433 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spi1P17433 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spi1P17433 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spi1P17433 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spi1P17433 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spi1P17433 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spi1P17433 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Spi1P17433 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spi1P17433 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spi1P17433 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spi1P17433 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spi1P17433 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spi1P17433 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spi1P17433 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms