Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Dnmt1P13864 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Dnmt1P13864 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Dnmt1P13864 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Dnmt1P13864 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
Dnmt1P13864 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Dnmt1P13864 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
Dnmt1P13864 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Dnmt1P13864 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Dnmt1P13864 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Dnmt1P13864 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Dnmt1P13864 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Dnmt1P13864 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Dnmt1P13864 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Dnmt1P13864 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Dnmt1P13864 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Dnmt1P13864 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
Dnmt1P13864 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Dnmt1P13864 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
Dnmt1P13864 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Dnmt1P13864 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Dnmt1P13864 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Dnmt1P13864 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
Dnmt1P13864 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Dnmt1P13864 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Dnmt1P13864 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Dnmt1P13864 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Dnmt1P13864 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Dnmt1P13864 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Dnmt1P13864 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Dnmt1P13864 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Dnmt1P13864 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Dnmt1P13864 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Dnmt1P13864 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Dnmt1P13864 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Dnmt1P13864 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
Dnmt1P13864 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Dnmt1P13864 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Dnmt1P13864 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Dnmt1P13864 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Dnmt1P13864 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Dnmt1P13864 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
Dnmt1P13864 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Dnmt1P13864 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Dnmt1P13864 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Dnmt1P13864 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Dnmt1P13864 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Dnmt1P13864 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Dnmt1P13864 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Dnmt1P13864 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
Dnmt1P13864 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Dnmt1P13864 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Dnmt1P13864 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
Dnmt1P13864 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Dnmt1P13864 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Dnmt1P13864 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
Dnmt1P13864 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Dnmt1P13864 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
Dnmt1P13864 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Dnmt1P13864 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
Dnmt1P13864 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Dnmt1P13864 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
Dnmt1P13864 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Dnmt1P13864 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Dnmt1P13864 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Dnmt1P13864 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Dnmt1P13864 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Dnmt1P13864 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Dnmt1P13864 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Dnmt1P13864 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Dnmt1P13864 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
Dnmt1P13864 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Dnmt1P13864 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Dnmt1P13864 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
Dnmt1P13864 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Dnmt1P13864 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Dnmt1P13864 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Dnmt1P13864 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Dnmt1P13864 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Dnmt1P13864 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Dnmt1P13864 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Dnmt1P13864 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Dnmt1P13864 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Dnmt1P13864 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Dnmt1P13864 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Dnmt1P13864 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Dnmt1P13864 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Dnmt1P13864 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Dnmt1P13864 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Dnmt1P13864 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms