Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndufb1P0DN34 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ndufb1P0DN34 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufb1P0DN34 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufb1P0DN34 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ndufb1P0DN34 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ndufb1P0DN34 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufb1P0DN34 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufb1P0DN34 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufb1P0DN34 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufb1P0DN34 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndufb1P0DN34 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb1P0DN34 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb1P0DN34 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufb1P0DN34 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufb1P0DN34 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufb1P0DN34 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufb1P0DN34 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufb1P0DN34 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufb1P0DN34 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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