Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a2P08122 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a2P08122 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a2P08122 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a2P08122 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a2P08122 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a2P08122 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a2P08122 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a2P08122 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a2P08122 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a2P08122 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a2P08122 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a2P08122 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a2P08122 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a2P08122 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a2P08122 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a2P08122 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a2P08122 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a2P08122 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a2P08122 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a2P08122 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a2P08122 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a2P08122 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a2P08122 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a2P08122 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a2P08122 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a2P08122 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a2P08122 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a2P08122 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a2P08122 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a2P08122 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Col4a2P08122 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a2P08122 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a2P08122 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a2P08122 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a2P08122 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a2P08122 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a2P08122 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a2P08122 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a2P08122 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a2P08122 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a2P08122 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a2P08122 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col4a2P08122 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a2P08122 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col4a2P08122 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a2P08122 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a2P08122 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a2P08122 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a2P08122 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a2P08122 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a2P08122 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col4a2P08122 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a2P08122 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a2P08122 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a2P08122 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a2P08122 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a2P08122 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a2P08122 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a2P08122 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a2P08122 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a2P08122 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a2P08122 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col4a2P08122 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col4a2P08122 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a2P08122 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a2P08122 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a2P08122 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a2P08122 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a2P08122 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a2P08122 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a2P08122 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col4a2P08122 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a2P08122 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a2P08122 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a2P08122 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a2P08122 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a2P08122 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms