Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spta1P08032 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spta1P08032 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spta1P08032 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spta1P08032 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spta1P08032 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spta1P08032 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spta1P08032 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spta1P08032 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spta1P08032 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Spta1P08032 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spta1P08032 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spta1P08032 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spta1P08032 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spta1P08032 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spta1P08032 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spta1P08032 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spta1P08032 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Spta1P08032 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spta1P08032 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spta1P08032 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spta1P08032 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spta1P08032 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spta1P08032 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spta1P08032 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spta1P08032 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spta1P08032 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spta1P08032 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spta1P08032 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spta1P08032 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spta1P08032 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spta1P08032 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spta1P08032 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spta1P08032 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spta1P08032 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Spta1P08032 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spta1P08032 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spta1P08032 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Spta1P08032 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spta1P08032 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Spta1P08032 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spta1P08032 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spta1P08032 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Spta1P08032 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spta1P08032 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spta1P08032 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spta1P08032 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spta1P08032 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spta1P08032 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Spta1P08032 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spta1P08032 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spta1P08032 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spta1P08032 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spta1P08032 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spta1P08032 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spta1P08032 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spta1P08032 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spta1P08032 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spta1P08032 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Spta1P08032 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spta1P08032 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spta1P08032 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Spta1P08032 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spta1P08032 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spta1P08032 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Spta1P08032 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spta1P08032 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spta1P08032 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spta1P08032 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spta1P08032 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Spta1P08032 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spta1P08032 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spta1P08032 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Spta1P08032 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spta1P08032 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spta1P08032 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spta1P08032 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spta1P08032 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spta1P08032 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spta1P08032 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms