Protein–RNA interactions for Protein: O70338

Rnaseh1, Ribonuclease H1, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh1O70338 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnaseh1O70338 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnaseh1O70338 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnaseh1O70338 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnaseh1O70338 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnaseh1O70338 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rnaseh1O70338 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnaseh1O70338 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnaseh1O70338 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnaseh1O70338 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnaseh1O70338 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rnaseh1O70338 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnaseh1O70338 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnaseh1O70338 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnaseh1O70338 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnaseh1O70338 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnaseh1O70338 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnaseh1O70338 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnaseh1O70338 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnaseh1O70338 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rnaseh1O70338 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnaseh1O70338 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rnaseh1O70338 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rnaseh1O70338 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnaseh1O70338 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnaseh1O70338 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnaseh1O70338 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnaseh1O70338 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnaseh1O70338 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnaseh1O70338 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnaseh1O70338 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnaseh1O70338 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnaseh1O70338 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnaseh1O70338 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnaseh1O70338 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnaseh1O70338 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnaseh1O70338 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnaseh1O70338 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnaseh1O70338 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnaseh1O70338 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnaseh1O70338 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnaseh1O70338 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnaseh1O70338 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnaseh1O70338 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnaseh1O70338 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnaseh1O70338 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnaseh1O70338 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnaseh1O70338 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnaseh1O70338 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnaseh1O70338 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnaseh1O70338 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnaseh1O70338 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnaseh1O70338 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnaseh1O70338 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnaseh1O70338 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnaseh1O70338 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnaseh1O70338 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnaseh1O70338 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnaseh1O70338 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnaseh1O70338 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnaseh1O70338 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnaseh1O70338 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnaseh1O70338 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnaseh1O70338 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnaseh1O70338 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnaseh1O70338 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnaseh1O70338 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnaseh1O70338 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rnaseh1O70338 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnaseh1O70338 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnaseh1O70338 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnaseh1O70338 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rnaseh1O70338 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rnaseh1O70338 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnaseh1O70338 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnaseh1O70338 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnaseh1O70338 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnaseh1O70338 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnaseh1O70338 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnaseh1O70338 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnaseh1O70338 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rnaseh1O70338 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnaseh1O70338 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnaseh1O70338 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnaseh1O70338 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnaseh1O70338 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnaseh1O70338 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnaseh1O70338 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnaseh1O70338 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rnaseh1O70338 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms