Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IlkO55222 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IlkO55222 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IlkO55222 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IlkO55222 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IlkO55222 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IlkO55222 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IlkO55222 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IlkO55222 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IlkO55222 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IlkO55222 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IlkO55222 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IlkO55222 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IlkO55222 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IlkO55222 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IlkO55222 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IlkO55222 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IlkO55222 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IlkO55222 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IlkO55222 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IlkO55222 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IlkO55222 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IlkO55222 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IlkO55222 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IlkO55222 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IlkO55222 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IlkO55222 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IlkO55222 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IlkO55222 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IlkO55222 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IlkO55222 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IlkO55222 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IlkO55222 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IlkO55222 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IlkO55222 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IlkO55222 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IlkO55222 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IlkO55222 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IlkO55222 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IlkO55222 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IlkO55222 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IlkO55222 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IlkO55222 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IlkO55222 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IlkO55222 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IlkO55222 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IlkO55222 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IlkO55222 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IlkO55222 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IlkO55222 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IlkO55222 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IlkO55222 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IlkO55222 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IlkO55222 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IlkO55222 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IlkO55222 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IlkO55222 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IlkO55222 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IlkO55222 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IlkO55222 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IlkO55222 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IlkO55222 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IlkO55222 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IlkO55222 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IlkO55222 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IlkO55222 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IlkO55222 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IlkO55222 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IlkO55222 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IlkO55222 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IlkO55222 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IlkO55222 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IlkO55222 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IlkO55222 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IlkO55222 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IlkO55222 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IlkO55222 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IlkO55222 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IlkO55222 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
IlkO55222 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IlkO55222 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IlkO55222 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IlkO55222 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IlkO55222 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IlkO55222 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IlkO55222 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IlkO55222 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IlkO55222 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IlkO55222 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IlkO55222 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IlkO55222 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IlkO55222 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IlkO55222 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IlkO55222 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IlkO55222 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IlkO55222 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IlkO55222 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IlkO55222 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IlkO55222 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IlkO55222 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms