Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
U90926O08546 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17,75■□□□□ 0,43
U90926O08546 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17,75■□□□□ 0,43
U90926O08546 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
U90926O08546 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
U90926O08546 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
U90926O08546 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
U90926O08546 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
U90926O08546 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17,7■□□□□ 0,42
U90926O08546 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17,7■□□□□ 0,42
U90926O08546 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,7■□□□□ 0,42
U90926O08546 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17,69■□□□□ 0,42
U90926O08546 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
U90926O08546 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17,68■□□□□ 0,42
U90926O08546 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17,67■□□□□ 0,42
U90926O08546 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
U90926O08546 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
U90926O08546 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
U90926O08546 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17,65■□□□□ 0,42
U90926O08546 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
U90926O08546 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
U90926O08546 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
U90926O08546 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,64■□□□□ 0,41
U90926O08546 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17,63■□□□□ 0,41
U90926O08546 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17,62■□□□□ 0,41
U90926O08546 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17,62■□□□□ 0,41
U90926O08546 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17,61■□□□□ 0,41
U90926O08546 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,61■□□□□ 0,41
U90926O08546 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
U90926O08546 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
U90926O08546 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17,58■□□□□ 0,4
U90926O08546 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
U90926O08546 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17,57■□□□□ 0,4
U90926O08546 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,56■□□□□ 0,4
U90926O08546 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
U90926O08546 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
U90926O08546 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
U90926O08546 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
U90926O08546 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
U90926O08546 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,54■□□□□ 0,4
U90926O08546 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
U90926O08546 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
U90926O08546 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17,52■□□□□ 0,4
U90926O08546 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
U90926O08546 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,51■□□□□ 0,39
U90926O08546 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
U90926O08546 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,51■□□□□ 0,39
U90926O08546 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
U90926O08546 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
U90926O08546 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
U90926O08546 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
U90926O08546 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17,47■□□□□ 0,39
U90926O08546 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
U90926O08546 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17,46■□□□□ 0,39
U90926O08546 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
U90926O08546 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
U90926O08546 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
U90926O08546 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
U90926O08546 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
U90926O08546 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
U90926O08546 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
U90926O08546 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
U90926O08546 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
U90926O08546 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,4■□□□□ 0,38
U90926O08546 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
U90926O08546 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
U90926O08546 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17,38■□□□□ 0,37
U90926O08546 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
U90926O08546 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
U90926O08546 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
U90926O08546 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17,37■□□□□ 0,37
U90926O08546 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
U90926O08546 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
U90926O08546 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
U90926O08546 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
U90926O08546 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
U90926O08546 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17,34■□□□□ 0,37
U90926O08546 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
U90926O08546 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
U90926O08546 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
U90926O08546 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17,31■□□□□ 0,36
U90926O08546 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
U90926O08546 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
U90926O08546 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
U90926O08546 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
U90926O08546 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
U90926O08546 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
U90926O08546 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17,28■□□□□ 0,36
U90926O08546 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17,27■□□□□ 0,36
U90926O08546 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,27■□□□□ 0,36
U90926O08546 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,35
U90926O08546 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17,26■□□□□ 0,35
U90926O08546 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
U90926O08546 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
U90926O08546 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
U90926O08546 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17,25■□□□□ 0,35
U90926O08546 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
U90926O08546 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
U90926O08546 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17,23■□□□□ 0,35
U90926O08546 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,4 ms