Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efna4O08542 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efna4O08542 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efna4O08542 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efna4O08542 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efna4O08542 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efna4O08542 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efna4O08542 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efna4O08542 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efna4O08542 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Efna4O08542 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efna4O08542 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efna4O08542 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efna4O08542 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna4O08542 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Efna4O08542 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efna4O08542 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna4O08542 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna4O08542 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Efna4O08542 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna4O08542 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna4O08542 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efna4O08542 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efna4O08542 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efna4O08542 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efna4O08542 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efna4O08542 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efna4O08542 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efna4O08542 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efna4O08542 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efna4O08542 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efna4O08542 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Efna4O08542 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efna4O08542 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efna4O08542 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efna4O08542 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efna4O08542 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efna4O08542 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efna4O08542 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efna4O08542 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efna4O08542 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efna4O08542 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efna4O08542 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efna4O08542 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efna4O08542 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efna4O08542 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efna4O08542 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efna4O08542 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efna4O08542 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efna4O08542 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efna4O08542 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efna4O08542 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efna4O08542 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efna4O08542 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efna4O08542 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efna4O08542 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efna4O08542 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efna4O08542 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna4O08542 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efna4O08542 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna4O08542 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna4O08542 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna4O08542 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efna4O08542 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efna4O08542 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efna4O08542 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna4O08542 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna4O08542 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna4O08542 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna4O08542 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna4O08542 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efna4O08542 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efna4O08542 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efna4O08542 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna4O08542 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna4O08542 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna4O08542 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna4O08542 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efna4O08542 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms