Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm20878L7N244 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm20878L7N244 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm20878L7N244 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm20878L7N244 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm20878L7N244 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm20878L7N244 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm20878L7N244 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm20878L7N244 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm20878L7N244 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm20878L7N244 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm20878L7N244 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm20878L7N244 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm20878L7N244 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm20878L7N244 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm20878L7N244 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm20878L7N244 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm20878L7N244 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm20878L7N244 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm20878L7N244 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm20878L7N244 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm20878L7N244 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm20878L7N244 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm20878L7N244 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm20878L7N244 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm20878L7N244 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm20878L7N244 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm20878L7N244 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm20878L7N244 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm20878L7N244 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm20878L7N244 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm20878L7N244 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm20878L7N244 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm20878L7N244 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm20878L7N244 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm20878L7N244 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm20878L7N244 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm20878L7N244 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm20878L7N244 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm20878L7N244 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm20878L7N244 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm20878L7N244 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm20878L7N244 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm20878L7N244 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm20878L7N244 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm20878L7N244 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm20878L7N244 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm20878L7N244 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm20878L7N244 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm20878L7N244 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm20878L7N244 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm20878L7N244 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm20878L7N244 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm20878L7N244 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm20878L7N244 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm20878L7N244 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm20878L7N244 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm20878L7N244 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm20878L7N244 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm20878L7N244 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm20878L7N244 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm20878L7N244 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm20878L7N244 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm20878L7N244 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm20878L7N244 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm20878L7N244 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm20878L7N244 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm20878L7N244 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm20878L7N244 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm20878L7N244 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm20878L7N244 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm20878L7N244 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm20878L7N244 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm20878L7N244 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm20878L7N244 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20878L7N244 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20878L7N244 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm20878L7N244 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm20878L7N244 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm20878L7N244 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm20878L7N244 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm20878L7N244 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm20878L7N244 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm20878L7N244 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm20878L7N244 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm20878L7N244 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm20878L7N244 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm20878L7N244 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm20878L7N244 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm20878L7N244 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm20878L7N244 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm20878L7N244 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm20878L7N244 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm20878L7N244 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm20878L7N244 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm20878L7N244 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm20878L7N244 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm20878L7N244 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm20878L7N244 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm20878L7N244 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms