Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2al1oL7MU04 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2al1oL7MU04 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2al1oL7MU04 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2al1oL7MU04 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2al1oL7MU04 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2al1oL7MU04 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2al1oL7MU04 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H2al1oL7MU04 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2al1oL7MU04 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2al1oL7MU04 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2al1oL7MU04 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2al1oL7MU04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2al1oL7MU04 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2al1oL7MU04 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2al1oL7MU04 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2al1oL7MU04 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2al1oL7MU04 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2al1oL7MU04 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2al1oL7MU04 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2al1oL7MU04 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2al1oL7MU04 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2al1oL7MU04 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2al1oL7MU04 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2al1oL7MU04 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2al1oL7MU04 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2al1oL7MU04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2al1oL7MU04 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2al1oL7MU04 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2al1oL7MU04 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2al1oL7MU04 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2al1oL7MU04 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2al1oL7MU04 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2al1oL7MU04 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2al1oL7MU04 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2al1oL7MU04 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2al1oL7MU04 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2al1oL7MU04 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H2al1oL7MU04 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2al1oL7MU04 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2al1oL7MU04 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2al1oL7MU04 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2al1oL7MU04 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2al1oL7MU04 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2al1oL7MU04 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H2al1oL7MU04 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2al1oL7MU04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H2al1oL7MU04 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2al1oL7MU04 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2al1oL7MU04 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2al1oL7MU04 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2al1oL7MU04 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2al1oL7MU04 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2al1oL7MU04 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2al1oL7MU04 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2al1oL7MU04 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2al1oL7MU04 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2al1oL7MU04 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2al1oL7MU04 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2al1oL7MU04 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2al1oL7MU04 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2al1oL7MU04 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2al1oL7MU04 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2al1oL7MU04 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2al1oL7MU04 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2al1oL7MU04 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2al1oL7MU04 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2al1oL7MU04 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2al1oL7MU04 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2al1oL7MU04 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2al1oL7MU04 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2al1oL7MU04 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2al1oL7MU04 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2al1oL7MU04 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2al1oL7MU04 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2al1oL7MU04 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2al1oL7MU04 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2al1oL7MU04 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms