Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm21887J3QQ04 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm21887J3QQ04 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21887J3QQ04 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21887J3QQ04 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21887J3QQ04 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms