Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
5830473C10RikF8VQ07 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
5830473C10RikF8VQ07 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
5830473C10RikF8VQ07 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
5830473C10RikF8VQ07 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
5830473C10RikF8VQ07 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
5830473C10RikF8VQ07 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
5830473C10RikF8VQ07 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
5830473C10RikF8VQ07 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
5830473C10RikF8VQ07 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
5830473C10RikF8VQ07 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
5830473C10RikF8VQ07 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
5830473C10RikF8VQ07 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
5830473C10RikF8VQ07 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
5830473C10RikF8VQ07 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
5830473C10RikF8VQ07 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
5830473C10RikF8VQ07 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
5830473C10RikF8VQ07 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
5830473C10RikF8VQ07 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
5830473C10RikF8VQ07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
5830473C10RikF8VQ07 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
5830473C10RikF8VQ07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
5830473C10RikF8VQ07 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
5830473C10RikF8VQ07 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
5830473C10RikF8VQ07 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
5830473C10RikF8VQ07 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
5830473C10RikF8VQ07 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
5830473C10RikF8VQ07 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
5830473C10RikF8VQ07 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
5830473C10RikF8VQ07 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
5830473C10RikF8VQ07 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
5830473C10RikF8VQ07 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
5830473C10RikF8VQ07 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
5830473C10RikF8VQ07 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
5830473C10RikF8VQ07 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
5830473C10RikF8VQ07 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
5830473C10RikF8VQ07 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
5830473C10RikF8VQ07 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
5830473C10RikF8VQ07 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
5830473C10RikF8VQ07 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
5830473C10RikF8VQ07 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
5830473C10RikF8VQ07 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
5830473C10RikF8VQ07 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
5830473C10RikF8VQ07 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
5830473C10RikF8VQ07 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
5830473C10RikF8VQ07 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
5830473C10RikF8VQ07 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
5830473C10RikF8VQ07 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
5830473C10RikF8VQ07 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
5830473C10RikF8VQ07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
5830473C10RikF8VQ07 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
5830473C10RikF8VQ07 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
5830473C10RikF8VQ07 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
5830473C10RikF8VQ07 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
5830473C10RikF8VQ07 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
5830473C10RikF8VQ07 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
5830473C10RikF8VQ07 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
5830473C10RikF8VQ07 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
5830473C10RikF8VQ07 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
5830473C10RikF8VQ07 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
5830473C10RikF8VQ07 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
5830473C10RikF8VQ07 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
5830473C10RikF8VQ07 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
5830473C10RikF8VQ07 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
5830473C10RikF8VQ07 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
5830473C10RikF8VQ07 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
5830473C10RikF8VQ07 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
5830473C10RikF8VQ07 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
5830473C10RikF8VQ07 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
5830473C10RikF8VQ07 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
5830473C10RikF8VQ07 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
5830473C10RikF8VQ07 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms