Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Usp32F8VPZ3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Usp32F8VPZ3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Usp32F8VPZ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Usp32F8VPZ3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Usp32F8VPZ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Usp32F8VPZ3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Usp32F8VPZ3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Usp32F8VPZ3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Usp32F8VPZ3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Usp32F8VPZ3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Usp32F8VPZ3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Usp32F8VPZ3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Usp32F8VPZ3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Usp32F8VPZ3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Usp32F8VPZ3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Usp32F8VPZ3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Usp32F8VPZ3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Usp32F8VPZ3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Usp32F8VPZ3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Usp32F8VPZ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Usp32F8VPZ3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Usp32F8VPZ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Usp32F8VPZ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Usp32F8VPZ3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Usp32F8VPZ3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Usp32F8VPZ3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Usp32F8VPZ3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Usp32F8VPZ3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Usp32F8VPZ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Usp32F8VPZ3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Usp32F8VPZ3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Usp32F8VPZ3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Usp32F8VPZ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Usp32F8VPZ3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Usp32F8VPZ3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Usp32F8VPZ3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Usp32F8VPZ3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Usp32F8VPZ3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Usp32F8VPZ3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Usp32F8VPZ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Usp32F8VPZ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Usp32F8VPZ3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Usp32F8VPZ3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Usp32F8VPZ3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Usp32F8VPZ3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Usp32F8VPZ3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Usp32F8VPZ3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Usp32F8VPZ3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Usp32F8VPZ3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Usp32F8VPZ3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Usp32F8VPZ3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Usp32F8VPZ3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Usp32F8VPZ3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Usp32F8VPZ3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Usp32F8VPZ3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Usp32F8VPZ3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Usp32F8VPZ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Usp32F8VPZ3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Usp32F8VPZ3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Usp32F8VPZ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Usp32F8VPZ3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Usp32F8VPZ3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Usp32F8VPZ3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Usp32F8VPZ3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Usp32F8VPZ3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Usp32F8VPZ3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Usp32F8VPZ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Usp32F8VPZ3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Usp32F8VPZ3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Usp32F8VPZ3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Usp32F8VPZ3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Usp32F8VPZ3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Usp32F8VPZ3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Usp32F8VPZ3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Usp32F8VPZ3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Usp32F8VPZ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Usp32F8VPZ3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Usp32F8VPZ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Usp32F8VPZ3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Usp32F8VPZ3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Usp32F8VPZ3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Usp32F8VPZ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Usp32F8VPZ3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Usp32F8VPZ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Usp32F8VPZ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Usp32F8VPZ3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Usp32F8VPZ3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Usp32F8VPZ3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Usp32F8VPZ3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Usp32F8VPZ3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Usp32F8VPZ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Usp32F8VPZ3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Usp32F8VPZ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Usp32F8VPZ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Usp32F8VPZ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Usp32F8VPZ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Usp32F8VPZ3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Usp32F8VPZ3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Usp32F8VPZ3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms