Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2cd2E9Q3C1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C2cd2E9Q3C1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2cd2E9Q3C1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2cd2E9Q3C1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
C2cd2E9Q3C1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C2cd2E9Q3C1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C2cd2E9Q3C1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C2cd2E9Q3C1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C2cd2E9Q3C1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2cd2E9Q3C1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C2cd2E9Q3C1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C2cd2E9Q3C1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2cd2E9Q3C1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2cd2E9Q3C1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C2cd2E9Q3C1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C2cd2E9Q3C1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C2cd2E9Q3C1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C2cd2E9Q3C1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2cd2E9Q3C1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C2cd2E9Q3C1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C2cd2E9Q3C1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C2cd2E9Q3C1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C2cd2E9Q3C1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C2cd2E9Q3C1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C2cd2E9Q3C1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2cd2E9Q3C1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2cd2E9Q3C1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C2cd2E9Q3C1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C2cd2E9Q3C1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2cd2E9Q3C1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C2cd2E9Q3C1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2cd2E9Q3C1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2cd2E9Q3C1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C2cd2E9Q3C1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C2cd2E9Q3C1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C2cd2E9Q3C1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C2cd2E9Q3C1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C2cd2E9Q3C1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C2cd2E9Q3C1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C2cd2E9Q3C1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C2cd2E9Q3C1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C2cd2E9Q3C1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C2cd2E9Q3C1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C2cd2E9Q3C1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C2cd2E9Q3C1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C2cd2E9Q3C1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C2cd2E9Q3C1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2cd2E9Q3C1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C2cd2E9Q3C1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C2cd2E9Q3C1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C2cd2E9Q3C1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C2cd2E9Q3C1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C2cd2E9Q3C1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C2cd2E9Q3C1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C2cd2E9Q3C1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C2cd2E9Q3C1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C2cd2E9Q3C1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C2cd2E9Q3C1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C2cd2E9Q3C1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C2cd2E9Q3C1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C2cd2E9Q3C1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C2cd2E9Q3C1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C2cd2E9Q3C1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C2cd2E9Q3C1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C2cd2E9Q3C1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2cd2E9Q3C1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2cd2E9Q3C1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2cd2E9Q3C1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2cd2E9Q3C1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C2cd2E9Q3C1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2cd2E9Q3C1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2cd2E9Q3C1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2cd2E9Q3C1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2cd2E9Q3C1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2cd2E9Q3C1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2cd2E9Q3C1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms