Protein–RNA interactions for Protein: E9PYH6

Setd1a, SET domain-containing 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1aE9PYH6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Setd1aE9PYH6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Setd1aE9PYH6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Setd1aE9PYH6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Setd1aE9PYH6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Setd1aE9PYH6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Setd1aE9PYH6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Setd1aE9PYH6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Setd1aE9PYH6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
Setd1aE9PYH6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Setd1aE9PYH6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Setd1aE9PYH6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Setd1aE9PYH6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Setd1aE9PYH6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Setd1aE9PYH6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Setd1aE9PYH6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Setd1aE9PYH6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Setd1aE9PYH6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Setd1aE9PYH6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Setd1aE9PYH6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Setd1aE9PYH6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Setd1aE9PYH6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Setd1aE9PYH6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Setd1aE9PYH6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Setd1aE9PYH6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Setd1aE9PYH6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Setd1aE9PYH6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Setd1aE9PYH6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Setd1aE9PYH6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Setd1aE9PYH6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
Setd1aE9PYH6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Setd1aE9PYH6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Setd1aE9PYH6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Setd1aE9PYH6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Setd1aE9PYH6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Setd1aE9PYH6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Setd1aE9PYH6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Setd1aE9PYH6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Setd1aE9PYH6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Setd1aE9PYH6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Setd1aE9PYH6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Setd1aE9PYH6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Setd1aE9PYH6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Setd1aE9PYH6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Setd1aE9PYH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Setd1aE9PYH6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Setd1aE9PYH6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Setd1aE9PYH6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Setd1aE9PYH6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Setd1aE9PYH6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Setd1aE9PYH6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Setd1aE9PYH6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Setd1aE9PYH6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Setd1aE9PYH6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Setd1aE9PYH6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Setd1aE9PYH6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Setd1aE9PYH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Setd1aE9PYH6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Setd1aE9PYH6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Setd1aE9PYH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Setd1aE9PYH6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Setd1aE9PYH6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Setd1aE9PYH6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Setd1aE9PYH6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Setd1aE9PYH6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Setd1aE9PYH6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Setd1aE9PYH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Setd1aE9PYH6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Setd1aE9PYH6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Setd1aE9PYH6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Setd1aE9PYH6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Setd1aE9PYH6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Setd1aE9PYH6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Setd1aE9PYH6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Setd1aE9PYH6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Setd1aE9PYH6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Setd1aE9PYH6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Setd1aE9PYH6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Setd1aE9PYH6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Setd1aE9PYH6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Setd1aE9PYH6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Setd1aE9PYH6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Setd1aE9PYH6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Setd1aE9PYH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Setd1aE9PYH6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Setd1aE9PYH6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setd1aE9PYH6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setd1aE9PYH6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Setd1aE9PYH6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Setd1aE9PYH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Setd1aE9PYH6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Setd1aE9PYH6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Setd1aE9PYH6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Setd1aE9PYH6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Setd1aE9PYH6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Setd1aE9PYH6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Setd1aE9PYH6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Setd1aE9PYH6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Setd1aE9PYH6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Setd1aE9PYH6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms