Protein–RNA interactions for Protein: E9PYH6

Setd1a, SET domain-containing 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1aE9PYH6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Setd1aE9PYH6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Setd1aE9PYH6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38,17■■■■□ 3,7
Setd1aE9PYH6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Setd1aE9PYH6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Setd1aE9PYH6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Setd1aE9PYH6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Setd1aE9PYH6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,7
Setd1aE9PYH6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,13■■■■□ 3,7
Setd1aE9PYH6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Setd1aE9PYH6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Setd1aE9PYH6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38,1■■■■□ 3,69
Setd1aE9PYH6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38,07■■■■□ 3,68
Setd1aE9PYH6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,67
Setd1aE9PYH6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38,01■■■■□ 3,67
Setd1aE9PYH6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Setd1aE9PYH6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Setd1aE9PYH6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Setd1aE9PYH6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Setd1aE9PYH6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37,94■■■■□ 3,66
Setd1aE9PYH6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Setd1aE9PYH6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Setd1aE9PYH6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Setd1aE9PYH6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC37,87■■■■□ 3,65
Setd1aE9PYH6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Setd1aE9PYH6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Setd1aE9PYH6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Setd1aE9PYH6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Setd1aE9PYH6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,64
Setd1aE9PYH6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC37,81■■■■□ 3,64
Setd1aE9PYH6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,81■■■■□ 3,64
Setd1aE9PYH6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Setd1aE9PYH6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Setd1aE9PYH6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,67■■■■□ 3,62
Setd1aE9PYH6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Setd1aE9PYH6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Setd1aE9PYH6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37,64■■■■□ 3,62
Setd1aE9PYH6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Setd1aE9PYH6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Setd1aE9PYH6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,62■■■■□ 3,61
Setd1aE9PYH6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Setd1aE9PYH6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37,59■■■■□ 3,61
Setd1aE9PYH6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37,59■■■■□ 3,61
Setd1aE9PYH6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37,58■■■■□ 3,61
Setd1aE9PYH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,61
Setd1aE9PYH6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Setd1aE9PYH6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Setd1aE9PYH6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Setd1aE9PYH6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37,53■■■■□ 3,6
Setd1aE9PYH6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Setd1aE9PYH6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Setd1aE9PYH6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37,51■■■■□ 3,6
Setd1aE9PYH6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Setd1aE9PYH6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Setd1aE9PYH6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Setd1aE9PYH6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Setd1aE9PYH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Setd1aE9PYH6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Setd1aE9PYH6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Setd1aE9PYH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Setd1aE9PYH6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Setd1aE9PYH6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Setd1aE9PYH6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37,41■■■■□ 3,58
Setd1aE9PYH6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Setd1aE9PYH6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37,41■■■■□ 3,58
Setd1aE9PYH6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Setd1aE9PYH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Setd1aE9PYH6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Setd1aE9PYH6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37,39■■■■□ 3,58
Setd1aE9PYH6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37,38■■■■□ 3,57
Setd1aE9PYH6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Setd1aE9PYH6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Setd1aE9PYH6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37,34■■■■□ 3,57
Setd1aE9PYH6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37,33■■■■□ 3,57
Setd1aE9PYH6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Setd1aE9PYH6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Setd1aE9PYH6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37,26■■■■□ 3,56
Setd1aE9PYH6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Setd1aE9PYH6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Setd1aE9PYH6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Setd1aE9PYH6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Setd1aE9PYH6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37,18■■■■□ 3,54
Setd1aE9PYH6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Setd1aE9PYH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Setd1aE9PYH6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Setd1aE9PYH6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Setd1aE9PYH6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Setd1aE9PYH6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Setd1aE9PYH6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Setd1aE9PYH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Setd1aE9PYH6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37,07■■■■□ 3,52
Setd1aE9PYH6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
Setd1aE9PYH6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Setd1aE9PYH6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Setd1aE9PYH6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Setd1aE9PYH6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Setd1aE9PYH6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37,02■■■■□ 3,52
Setd1aE9PYH6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Setd1aE9PYH6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Setd1aE9PYH6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37,01■■■■□ 3,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,4 ms