Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Clrn2B2RVW2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clrn2B2RVW2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clrn2B2RVW2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clrn2B2RVW2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Clrn2B2RVW2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clrn2B2RVW2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Clrn2B2RVW2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clrn2B2RVW2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clrn2B2RVW2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Clrn2B2RVW2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Clrn2B2RVW2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Clrn2B2RVW2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clrn2B2RVW2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clrn2B2RVW2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clrn2B2RVW2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clrn2B2RVW2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Clrn2B2RVW2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Clrn2B2RVW2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clrn2B2RVW2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clrn2B2RVW2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Clrn2B2RVW2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Clrn2B2RVW2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Clrn2B2RVW2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Clrn2B2RVW2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Clrn2B2RVW2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clrn2B2RVW2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Clrn2B2RVW2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Clrn2B2RVW2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Clrn2B2RVW2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Clrn2B2RVW2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clrn2B2RVW2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Clrn2B2RVW2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Clrn2B2RVW2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Clrn2B2RVW2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Clrn2B2RVW2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Clrn2B2RVW2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Clrn2B2RVW2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clrn2B2RVW2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Clrn2B2RVW2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Clrn2B2RVW2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Clrn2B2RVW2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Clrn2B2RVW2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Clrn2B2RVW2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clrn2B2RVW2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clrn2B2RVW2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Clrn2B2RVW2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Clrn2B2RVW2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clrn2B2RVW2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clrn2B2RVW2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clrn2B2RVW2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Clrn2B2RVW2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Clrn2B2RVW2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Clrn2B2RVW2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clrn2B2RVW2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Clrn2B2RVW2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Clrn2B2RVW2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Clrn2B2RVW2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clrn2B2RVW2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clrn2B2RVW2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Clrn2B2RVW2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clrn2B2RVW2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clrn2B2RVW2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Clrn2B2RVW2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Clrn2B2RVW2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clrn2B2RVW2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Clrn2B2RVW2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clrn2B2RVW2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clrn2B2RVW2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clrn2B2RVW2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clrn2B2RVW2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clrn2B2RVW2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clrn2B2RVW2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clrn2B2RVW2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clrn2B2RVW2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clrn2B2RVW2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clrn2B2RVW2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clrn2B2RVW2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Clrn2B2RVW2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clrn2B2RVW2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clrn2B2RVW2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Clrn2B2RVW2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Clrn2B2RVW2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clrn2B2RVW2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clrn2B2RVW2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Clrn2B2RVW2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Clrn2B2RVW2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Clrn2B2RVW2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Clrn2B2RVW2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Clrn2B2RVW2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms