Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,66■■■■■ 4,26
NhsB1AV60 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41,66■■■■■ 4,26
NhsB1AV60 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC41,64■■■■■ 4,26
NhsB1AV60 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,62■■■■■ 4,25
NhsB1AV60 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,58■■■■■ 4,25
NhsB1AV60 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
NhsB1AV60 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,51■■■■■ 4,24
NhsB1AV60 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
NhsB1AV60 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41,47■■■■■ 4,23
NhsB1AV60 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC41,44■■■■■ 4,22
NhsB1AV60 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,43■■■■■ 4,22
NhsB1AV60 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41,4■■■■■ 4,22
NhsB1AV60 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
NhsB1AV60 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
NhsB1AV60 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
NhsB1AV60 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,32■■■■■ 4,21
NhsB1AV60 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC41,31■■■■■ 4,2
NhsB1AV60 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41,31■■■■■ 4,2
NhsB1AV60 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
NhsB1AV60 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41,29■■■■■ 4,2
NhsB1AV60 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
NhsB1AV60 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,26■■■■■ 4,2
NhsB1AV60 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41,26■■■■■ 4,2
NhsB1AV60 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,24■■■■■ 4,19
NhsB1AV60 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
NhsB1AV60 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
NhsB1AV60 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
NhsB1AV60 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,17■■■■■ 4,18
NhsB1AV60 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41,16■■■■■ 4,18
NhsB1AV60 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
NhsB1AV60 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41,14■■■■■ 4,18
NhsB1AV60 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41,11■■■■■ 4,17
NhsB1AV60 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41,1■■■■■ 4,17
NhsB1AV60 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
NhsB1AV60 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
NhsB1AV60 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
NhsB1AV60 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
NhsB1AV60 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,08■■■■■ 4,17
NhsB1AV60 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
NhsB1AV60 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,17
NhsB1AV60 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,16
NhsB1AV60 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
NhsB1AV60 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
NhsB1AV60 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
NhsB1AV60 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41,04■■■■■ 4,16
NhsB1AV60 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC41,02■■■■■ 4,16
NhsB1AV60 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
NhsB1AV60 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
NhsB1AV60 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40,98■■■■■ 4,15
NhsB1AV60 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC40,98■■■■■ 4,15
NhsB1AV60 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40,96■■■■■ 4,15
NhsB1AV60 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC40,89■■■■■ 4,14
NhsB1AV60 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
NhsB1AV60 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
NhsB1AV60 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40,85■■■■■ 4,13
NhsB1AV60 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC40,85■■■■■ 4,13
NhsB1AV60 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC40,85■■■■■ 4,13
NhsB1AV60 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
NhsB1AV60 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
NhsB1AV60 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC40,81■■■■■ 4,12
NhsB1AV60 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC40,8■■■■■ 4,12
NhsB1AV60 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC40,78■■■■■ 4,12
NhsB1AV60 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
NhsB1AV60 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40,71■■■■■ 4,11
NhsB1AV60 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC40,68■■■■■ 4,1
NhsB1AV60 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,1
NhsB1AV60 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
NhsB1AV60 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
NhsB1AV60 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
NhsB1AV60 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40,53■■■■■ 4,08
NhsB1AV60 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40,53■■■■■ 4,08
NhsB1AV60 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
NhsB1AV60 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40,45■■■■■ 4,07
NhsB1AV60 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40,42■■■■■ 4,06
NhsB1AV60 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC40,41■■■■■ 4,06
NhsB1AV60 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40,4■■■■■ 4,06
NhsB1AV60 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
NhsB1AV60 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40,34■■■■■ 4,05
NhsB1AV60 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,04
NhsB1AV60 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,04
NhsB1AV60 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,31■■■■■ 4,04
NhsB1AV60 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,29■■■■■ 4,04
NhsB1AV60 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,27■■■■■ 4,04
NhsB1AV60 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
NhsB1AV60 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
NhsB1AV60 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
NhsB1AV60 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,24■■■■■ 4,03
NhsB1AV60 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40,23■■■■■ 4,03
NhsB1AV60 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
NhsB1AV60 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
NhsB1AV60 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40,16■■■■■ 4,02
NhsB1AV60 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
NhsB1AV60 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
NhsB1AV60 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC40,13■■■■■ 4,02
NhsB1AV60 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,01
NhsB1AV60 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,12■■■■■ 4,01
NhsB1AV60 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4,01
NhsB1AV60 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40,07■■■■■ 4,01
NhsB1AV60 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40,02■■■■■ 4
NhsB1AV60 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,02■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,3 ms