Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Btbd35f28A2CFD5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Btbd35f28A2CFD5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Btbd35f28A2CFD5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Btbd35f28A2CFD5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Btbd35f28A2CFD5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Btbd35f28A2CFD5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Btbd35f28A2CFD5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Btbd35f28A2CFD5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Btbd35f28A2CFD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Btbd35f28A2CFD5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Btbd35f28A2CFD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Btbd35f28A2CFD5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Btbd35f28A2CFD5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Btbd35f28A2CFD5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Btbd35f28A2CFD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Btbd35f28A2CFD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Btbd35f28A2CFD5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Btbd35f28A2CFD5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Btbd35f28A2CFD5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Btbd35f28A2CFD5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Btbd35f28A2CFD5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Btbd35f28A2CFD5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Btbd35f28A2CFD5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Btbd35f28A2CFD5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Btbd35f28A2CFD5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Btbd35f28A2CFD5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Btbd35f28A2CFD5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Btbd35f28A2CFD5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Btbd35f28A2CFD5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Btbd35f28A2CFD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Btbd35f28A2CFD5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Btbd35f28A2CFD5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Btbd35f28A2CFD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Btbd35f28A2CFD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Btbd35f28A2CFD5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Btbd35f28A2CFD5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Btbd35f28A2CFD5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Btbd35f28A2CFD5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Btbd35f28A2CFD5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Btbd35f28A2CFD5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Btbd35f28A2CFD5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Btbd35f28A2CFD5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Btbd35f28A2CFD5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Btbd35f28A2CFD5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Btbd35f28A2CFD5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Btbd35f28A2CFD5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Btbd35f28A2CFD5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Btbd35f28A2CFD5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Btbd35f28A2CFD5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Btbd35f28A2CFD5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Btbd35f28A2CFD5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Btbd35f28A2CFD5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Btbd35f28A2CFD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Btbd35f28A2CFD5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Btbd35f28A2CFD5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Btbd35f28A2CFD5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Btbd35f28A2CFD5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Btbd35f28A2CFD5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Btbd35f28A2CFD5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Btbd35f28A2CFD5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Btbd35f28A2CFD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Btbd35f28A2CFD5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Btbd35f28A2CFD5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Btbd35f28A2CFD5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Btbd35f28A2CFD5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Btbd35f28A2CFD5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Btbd35f28A2CFD5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Btbd35f28A2CFD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Btbd35f28A2CFD5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms