Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec16aA2AIX1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec16aA2AIX1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec16aA2AIX1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sec16aA2AIX1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec16aA2AIX1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec16aA2AIX1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec16aA2AIX1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec16aA2AIX1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec16aA2AIX1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec16aA2AIX1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec16aA2AIX1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sec16aA2AIX1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec16aA2AIX1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec16aA2AIX1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec16aA2AIX1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sec16aA2AIX1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec16aA2AIX1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec16aA2AIX1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec16aA2AIX1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec16aA2AIX1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Sec16aA2AIX1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec16aA2AIX1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec16aA2AIX1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec16aA2AIX1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sec16aA2AIX1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec16aA2AIX1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec16aA2AIX1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec16aA2AIX1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec16aA2AIX1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec16aA2AIX1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec16aA2AIX1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec16aA2AIX1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec16aA2AIX1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec16aA2AIX1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec16aA2AIX1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec16aA2AIX1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec16aA2AIX1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec16aA2AIX1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec16aA2AIX1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec16aA2AIX1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec16aA2AIX1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sec16aA2AIX1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec16aA2AIX1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec16aA2AIX1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec16aA2AIX1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec16aA2AIX1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec16aA2AIX1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec16aA2AIX1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec16aA2AIX1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec16aA2AIX1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec16aA2AIX1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec16aA2AIX1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec16aA2AIX1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec16aA2AIX1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec16aA2AIX1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sec16aA2AIX1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec16aA2AIX1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec16aA2AIX1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec16aA2AIX1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec16aA2AIX1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec16aA2AIX1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec16aA2AIX1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec16aA2AIX1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec16aA2AIX1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec16aA2AIX1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec16aA2AIX1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec16aA2AIX1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec16aA2AIX1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sec16aA2AIX1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec16aA2AIX1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec16aA2AIX1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec16aA2AIX1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec16aA2AIX1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec16aA2AIX1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms