Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm8391-201ENSMUST00000185632 726 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Cnfn-201ENSMUST00000076276 524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Slamf9-201ENSMUST00000027830 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Trim34a-203ENSMUST00000106849 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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CubnQ9JLB4 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
CubnQ9JLB4 Olfr400-ps1-201ENSMUST00000118094 955 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms