Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Trp53i11Q4QQM4 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trp53i11Q4QQM4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms