Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Siah1bQ06985 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms