Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms