Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gp1bbP56400 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms