Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZfaP23607 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ZfaP23607 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZfaP23607 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms