Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
P10404 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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P10404 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
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P10404 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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P10404 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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P10404 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
P10404 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
P10404 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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