Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Usf3B2RUQ2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms