Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Derl3Q9D8K3 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms