Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms