Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nup88Q8CEC0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms