Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms