Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Ssx9Q6XAS3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssx9Q6XAS3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms