Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm15663-201ENSMUST00000145794 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Orai2-202ENSMUST00000196454 3990 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm28988-201ENSMUST00000191363 1897 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm17816-201ENSMUST00000219991 2603 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Lysmd4-204ENSMUST00000207823 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Trim17-202ENSMUST00000075141 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Mpp1-201ENSMUST00000033775 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm10629-201ENSMUST00000137706 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Tmem106a-202ENSMUST00000100403 2428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Top3a-202ENSMUST00000102668 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Arhgef3-201ENSMUST00000049206 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 3930402G23Rik-201ENSMUST00000040608 3086 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Acsl6-205ENSMUST00000094194 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Bfar-202ENSMUST00000069281 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Prokr2-202ENSMUST00000110156 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Chat-201ENSMUST00000070125 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Chrm1-201ENSMUST00000035444 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Olfr601-202ENSMUST00000210431 2266 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Nnt-206ENSMUST00000223268 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Cald1-204ENSMUST00000115026 4080 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Cntln-203ENSMUST00000107190 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cbx1P83917 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms