Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms