Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CitP49025 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CitP49025 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CitP49025 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CitP49025 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CitP49025 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CitP49025 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CitP49025 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CitP49025 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CitP49025 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CitP49025 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CitP49025 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms