Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VdrP48281 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VdrP48281 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VdrP48281 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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VdrP48281 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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VdrP48281 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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VdrP48281 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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VdrP48281 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VdrP48281 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms