Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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Pou3f1P21952 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Pou3f1P21952 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Pou3f1P21952 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Pou3f1P21952 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Pou3f1P21952 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Pou3f1P21952 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Pou3f1P21952 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms