Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18532 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18532 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms