Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tgfb1P04202 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms