Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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Gm2035J3QP87 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Gm2035J3QP87 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Gm2035J3QP87 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Gm2035J3QP87 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Gm2035J3QP87 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Gm2035J3QP87 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Gm2035J3QP87 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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