Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Arhgef3-201ENSMUST00000049206 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Fam221b-201ENSMUST00000056474 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Zfp563-201ENSMUST00000131722 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm44815-201ENSMUST00000206812 1633 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm36958-201ENSMUST00000192388 1875 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Kif3a-203ENSMUST00000120613 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Smoc1-201ENSMUST00000021564 3439 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Acsl6-205ENSMUST00000094194 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Olfr601-202ENSMUST00000210431 2266 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm16630-201ENSMUST00000180741 3257 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Mylk3-201ENSMUST00000034133 3696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Nt5c1b-203ENSMUST00000143739 1570 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Rrn3-201ENSMUST00000023363 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Trpv2-202ENSMUST00000102643 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Ptk2-209ENSMUST00000226988 4444 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Pa2g4-201ENSMUST00000026425 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm45694-201ENSMUST00000212022 3251 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Smim18J3QNP2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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