Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim39Q9ESN2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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