Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Rab3b-203ENSMUST00000106651 1078 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm21818-201ENSMUST00000178828 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm14264-201ENSMUST00000147141 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Cfap77-202ENSMUST00000157048 1042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Zfp410-208ENSMUST00000222258 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Wfs1-202ENSMUST00000166339 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm32849-201ENSMUST00000208696 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 1700108F19Rik-205ENSMUST00000190818 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm32255-201ENSMUST00000219456 1349 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm8606-201ENSMUST00000121482 888 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm43110-201ENSMUST00000198877 226 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Lgals9-201ENSMUST00000073001 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cdh23Q99PF4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cdh23Q99PF4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm11307-201ENSMUST00000121088 929 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Rit1-207ENSMUST00000172252 820 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm4925-201ENSMUST00000092231 397 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Mettl18-201ENSMUST00000045694 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Olfr400-ps1-201ENSMUST00000118094 955 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Vpreb3-202ENSMUST00000121151 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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