Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms