Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ciao1Q99KN2 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms