Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc21aQ8C0S4 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc21aQ8C0S4 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc21aQ8C0S4 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc21aQ8C0S4 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc21aQ8C0S4 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc21aQ8C0S4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc21aQ8C0S4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc21aQ8C0S4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc21aQ8C0S4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc21aQ8C0S4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc21aQ8C0S4 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc21aQ8C0S4 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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