Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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