Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms