Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 n-R5s5-201ENSMUST00000083134 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc18Q640L5 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Ccdc18Q640L5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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